Analýza interakcí podjednotek SMC5-6 komplexu s DNA

SMC5-6 komplex patří spolu s kohezinem a kondenzinem do rodiny SMC (Structure Maintenance of Chromosome) komplexů, které mají za úkol regulovat strukturu a dynamiku chromatinu a podílet se na opravě poškozené DNA. V této práci se podařilo purifikovat přírodní i mutovaný proteinový dimer NSE1-NSE3. M...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Fabišik, Matěj (Autor práce)
Další autoři: Paleček, Jan, 1966- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Slovenština
Vydáno: 2012
Témata:
biopolymery
chromozomy
nukleové kyseliny
SMC
SMC5-6 complex
biopolymers
chromosomes
nucleic acids
bakalářské práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/358116/prif_b/
Obálka
Popis
Shrnutí:SMC5-6 komplex patří spolu s kohezinem a kondenzinem do rodiny SMC (Structure Maintenance of Chromosome) komplexů, které mají za úkol regulovat strukturu a dynamiku chromatinu a podílet se na opravě poškozené DNA. V této práci se podařilo purifikovat přírodní i mutovaný proteinový dimer NSE1-NSE3. Metodou EMSA se podařilo prokázat, že protein NSE1-NSE3 váže DNA. Tato vazba je ovlivněná délkou DNA. Dimer NSE1-NSE3 je schopný vázat DNA i při vyšších iontových podmínkách. Analýzou mutovaných proteinových komplexů NSE1-NSE3 se potvrdila vazba DNA na oba proteiny dimeru NSE1-NSE3. Toto zjištění přineslo nové poznatky o DNA-vazebné schopnosti proteinových dimerů NSE1-NSE3 patřících do SMC5-6 komplexu.
SMC5-6 complex belongs with cohesin and condensin to a family of SMC (Structure Maintenance of Chromosome) complexes whose role is to regulate a structure and dynamics of chromatin and participate in the reparation of the damaged DNA. We have managed to purify wild type and mutant protein dimer NSE1-NSE3 in this thesis. The EMSA method was used to prove that NSE1-NSE3 binds DNA. This bind is affected by the length of DNA. The dimer NSE1-NSE3 can bind DNA also at higher ionic conditions. The DNA binding to both proteins of dimer NSE1-NSE3 was confirmed by an analysis of his mutants. The discovery has brought greater understanding of the DNA-binding ability of protein dimer NSE1-NSE3 belonging to SMC5-6 complex.
Popis jednotky:Vedoucí práce: Jan Paleček
Fyzický popis:46 l. : il.

Podobné jednotky