Poloha nukleozómů a metody jejího stanovení
V této bakalářské práci se věnuji poloze nukleozómů a prediktivním i experimentálním metodám jejího stanovení. Poloha nukleozómů v genomu je determinována hlavně deformačními vlastnostmi DNA. Matice ohýbatelnosti DNA může být použita pro predikci polohy nukleozómů z libovolné sekvence. Experimentáln...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2012
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/357472/prif_b/ |
| Shrnutí: | V této bakalářské práci se věnuji poloze nukleozómů a prediktivním i experimentálním metodám jejího stanovení. Poloha nukleozómů v genomu je determinována hlavně deformačními vlastnostmi DNA. Matice ohýbatelnosti DNA může být použita pro predikci polohy nukleozómů z libovolné sekvence. Experimentální mapování nukleozómů obvykle zahrnuje štěpení mikrokokovou nukleázou a následné sekvencování. Experimentální i prediktivní metody se využívají pro vytváření celogenomových map nukleozómů, které přináší nové poznatky o lokální struktuře a funkci chromatinu. In this thesis, I focus on nucleosome positioning and predictive and experimental methods of its determination. Nucleosome positioning along genome is guided primarily by deformational properties of DNA. Matrix of DNA bendability can be used for sequence-directed mapping of the nucleosomes for any sequence. Experimental mapping of nucleosomes has been performed mainly by the micrococcal nuclease digestion followed by sequencing. Both experimental and predictive methods are used to create genome-wide nucleosome maps which brings new information about local stucture and function of chromatin. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Jiří Fajkus |
| Fyzický popis: | 42 l. |