Graph Cut Based Image Segmentation in Fluorescence Microscopy

Vývoj v moderní éře molekulární a buněčné biologie je hnaný ohromným technologickým pokrokem několika posledních dekád. Nové nástroje jako fluorescenční mikroskopy s vysokým rozlišením společně s vývojem fluorescenčních sond umožňují biologům pozorovat buněčné komponenty včetně proteinů, chromosomů...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Daněk, Ondřej (Autor práce)
Další autoři: Kozubek, Michal, 1974- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2012
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/60931/fi_d/
Obálka
LEADER 05711ctm a22009257a 4500
001 MUB01000720377
003 CZ BrMU
005 20240513153835.0
008 120621s2012 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
035 |a (ISMU-VSKP)139127 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD018 
072 7 |a 004.4/.6  |x Programování. Software  |2 Konspekt  |9 23 
072 7 |a 57  |x Obecná biologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 621.397  |2 MRF 
080 |a 004.421  |2 MRF 
080 |a 57/59  |2 MRF 
080 |a 57:61  |2 MRF 
080 |a 515.1  |2 MRF 
080 |a 57.086.2:535.37  |2 MRF 
100 1 |a Daněk, Ondřej  |% UČO 60931  |* [absolvent FI MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Graph Cut Based Image Segmentation in Fluorescence Microscopy  |y eng 
245 1 0 |a Graph Cut Based Image Segmentation in Fluorescence Microscopy  |h [rukopis] /  |c Ondřej Daněk 
260 |c 2012 
300 |a x, 144 s. 
500 |a Vedoucí práce: Michal Kozubek 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Fakulta informatiky, 2012 
520 2 |a Vývoj v moderní éře molekulární a buněčné biologie je hnaný ohromným technologickým pokrokem několika posledních dekád. Nové nástroje jako fluorescenční mikroskopy s vysokým rozlišením společně s vývojem fluorescenčních sond umožňují biologům pozorovat buněčné komponenty včetně proteinů, chromosomů nebo dokonce jednotlivých genů a studovat dynamiku rozličných biologických procesů na mikroskopické úrovni. Avšak ruční zpracování rozsáhlých datových souborů získaných v těchto experimentech je těžkopádné a náchylné k chybám a vytváří proto přirozenou poptávku po spolehlivých kvantitativních metodách založených na rychlých a robustních automatických nebo alespoň částečně automatických algoritmech pro zpracování obrazu, které umožní získat nezkreslené výsledky. Jedním z klíčových kroků ve zpracování biomedicínského obrazu je segmentace, jejíž cílem je nalezení studovaných objektů v obraze. Přední roli v současném výzkumu segmentace hrají sofistikované a matematicky dobře podložené metody za  |% cze 
520 2 9 |a The progress in the modern era of molecular and cell biology is driven by the tremendous technological advances of the last few decades. Hardware tools such as high-resolution fluorescence microscopes together with the development of fluorescent probes allow biologists to observe sub-cellular components including chromosomes or even individual genes and proteins and study the dynamics of diverse processes at microscopic level. However, manual analysis of large data sets obtained in such experiments is cumbersome and error prone and thus creates a natural demand for reliable quantitative methods based on fast and robust automatic or semi-automatic image processing algorithms to produce unbiased statistics. One of the critical parts in biomedical image analysis is segmentation, aiming for accurate object localization. A prominent role in the current research of segmentation is played by sophisticated and mathematically well-founded methods based on energy minimization. Among these, the  |9 eng 
650 0 7 |a algoritmy (programování)  |7 ph131788  |2 czenas 
650 0 7 |a biologie  |7 ph114166  |2 czenas 
650 0 7 |a zpracování obrazu  |7 ph210245  |2 czenas 
650 0 7 |a fluorescenční mikroskopie  |7 ph471369  |2 czenas 
650 0 7 |a biomedicína  |7 ph165181  |2 czenas 
650 0 7 |a topologie  |7 ph116463  |2 czenas 
650 0 9 |a fluorescence microscopy  |2 eczenas 
650 0 9 |a biology  |2 eczenas 
650 0 9 |a computer algorithms  |2 eczenas 
650 0 9 |a image processing  |2 eczenas 
650 0 9 |a biomedicine  |2 eczenas 
650 0 9 |a topology  |2 eczenas 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Informatika (čtyřleté)  |b Informatika  |c FI D-IN4 IN (IN)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kozubek, Michal,  |d 1974-  |7 ola2003204934  |% UČO 3740  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Katedra počítačové grafiky a designu  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/60931/fi_d/ 
CAT |c 20120621  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120831  |l MUB01  |h 1008 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1429 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130530  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130822  |l MUB01  |h 1101 
CAT |a VESELA  |b 02  |c 20140314  |l MUB01  |h 1041 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1609 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1103 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20141006  |l MUB01  |h 1341 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1205 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1449 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151209  |l MUB01  |h 0834 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0243 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160218  |l MUB01  |h 0731 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160315  |l MUB01  |h 0658 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160913  |l MUB01  |h 1500 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20161116  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20170329  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180130  |l MUB01  |h 0802 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180411  |l MUB01  |h 0813 
CAT |c 20200507  |l MUB01  |h 1111 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0959 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1948 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1214 
CAT |a VESELAX  |b 02  |c 20240513  |l MUB01  |h 1535 
CAT |a VESELAX  |b 02  |c 20240513  |l MUB01  |h 1537 
CAT |a VESELAX  |b 02  |c 20240513  |l MUB01  |h 1537 
CAT |a VESELAX  |b 02  |c 20240513  |l MUB01  |h 1538 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 FI  |a Fakulta informatiky  |2 SKLAD  |b sklad  |3 Diz. práce 2012  |5 42005D2621  |8 20140313  |f 72  |f Týdenní  |r 20140313 
AVA |a INF50  |b FI  |c sklad  |d Diz. práce 2012  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD