Bioinformatic analysis and design of haloalkane dehalogenases

Halogenalkandehalogenasy jsou enzymy se širokou substrátovou specificitou, které katalyzují hydrolytický rozklad řady halogenovaných uhlovodíků, včetně významných polutantů životního prostředí. Cílem této práce bylo: (i) rozšířit dosavadní znalosti o halogenalkandehalogenasach o informace týkající s...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Šebestová, Eva, 1980- (Autor práce)
Další autoři: Damborský, Jiří, 1969- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2011
Témata:
bioinformatika
enzymy
halogenalkandehalogenasa
substrátová specificita
bioinformatics
enzymes
haloalkane dehalogenase
substrate specificity
disertace
CD-ROM
dissertations
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/40707/prif_d/
Obálka
LEADER 05432ctm a22008057a 4500
001 MUB01000704391
003 CZ BrMU
005 20200310231256.0
008 120125s2011 xr |||||q|||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-04-01 
040 |a BOD035  |b cze  |d BOD114 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 575.112  |2 MRF 
080 |a 577.15  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Šebestová, Eva,  |d 1980-  |7 mub2013800408  |% UČO 179291  |4 dis 
245 1 0 |a Bioinformatic analysis and design of haloalkane dehalogenases  |h [elektronický zdroj] /  |c Eva Chovancová 
246 1 1 |a Bioinformatická analýza a design halogenalkandehalogenas 
260 |c 2011 
300 |a 1 CD-ROM 
500 |a Vedoucí práce: Jiří Damborský 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Halogenalkandehalogenasy jsou enzymy se širokou substrátovou specificitou, které katalyzují hydrolytický rozklad řady halogenovaných uhlovodíků, včetně významných polutantů životního prostředí. Cílem této práce bylo: (i) rozšířit dosavadní znalosti o halogenalkandehalogenasach o informace týkající se evolučních a funkčních vztahů mezi jednotlivými členy této rodiny a (ii) vyvinout dva bioinformatické nástroje pro racionální design enzymů s vylepšenými katalytickými vlastnostmi. Na základě fylogenetické analýzy byla rodina halogenalkandehalogenas rozdělena do tří podrodin, z nichž jedna nebyla dosud v literatuře pospána. Pro tuto podrodinu byl předpovězen nový typ katalytické pentády. Studie dále zmapovala hlavní evoluční události, které vedly k vývoji současných halogenalkandehalogenas, a to změnu katalytických reziduí a přestavbu víčkové domény. Jako oblast důležitá pro adaptaci halogenalkandehalogenas k novým substrátům byla předpovězena N-koncová část víčkové domény a také ...  |% cze 
520 2 9 |a Haloalkane dehalogenases are broad-specificity enzymes catalyzing the hydrolysis of numerous halogenated hydrocarbons, including environmental pollutants. The aim of this Thesis was to: (i) extend the knowledge about this environmentally important family of enzymes by information about the evolutionary and functional relationships among its members and (ii) develop two bioinformatics tools facilitating the rational design of enzymes with improved catalytic properties. Phylogenetic analysis suggested subdivision of haloalkane dehalogenases into three subfamilies, of which one comprised exclusively putative members. A novel type of the catalytic pentad composition was predicted for this new subfamily. The main evolutionary events of haloalkane dehalogenases, i.e., the repositioning of the catalytic pentad residues and the change of the composition of the cap domain, were elucidated. The N-terminal part of the cap domain and the access tunnels were proposed as important sites for ...  |9 eng 
650 0 7 |a bioinformatika  |7 ph194800  |2 czenas 
650 0 7 |a enzymy  |7 ph119969  |2 czenas 
650 0 7 |a halogenalkandehalogenasa  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a substrátová specificita  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a bioinformatics  |2 eczenas 
650 0 9 |a enzymes  |2 eczenas 
650 0 9 |a haloalkane dehalogenase  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a substrate specificity  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 7 |a CD-ROM  |7 fd133955  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Chemie (čtyřleté)  |b Chemie životního prostředí  |c PřF D-CH4 CHZP (CHZP)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Damborský, Jiří,  |d 1969-  |7 mzk2006348900  |% UČO 1441  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/40707/prif_d/ 
CAT |a VARTECKA  |b 02  |c 20120125  |l MUB01  |h 0857 
CAT |a VARTECKA  |b 02  |c 20120125  |l MUB01  |h 0916 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0155 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2037 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20121001  |l MUB01  |h 1055 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130925  |l MUB01  |h 1019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130925  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20131218  |l MUB01  |h 1042 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20131218  |l MUB01  |h 1043 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20131218  |l MUB01  |h 1050 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140102  |l MUB01  |h 1712 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140107  |l MUB01  |h 1228 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140909  |l MUB01  |h 1206 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1448 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0227 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160829  |l MUB01  |h 1628 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170502  |l MUB01  |h 1655 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170731  |l MUB01  |h 1711 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20200310  |l MUB01  |h 2312 
CAT |c 20200401  |l MUB01  |h 1256 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0957 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1946 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230920  |l MUB01  |h 0942 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240703  |l MUB01  |h 0129 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-04-01 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m CDROM  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 VV  |b KUK - volný výběr  |3 549-CHOV  |5 3285004146  |7 CD ROM si vyžádejte u knihovníka u výpůjčního pultu  |8 20120125  |f 70  |f Prezenční  |r 20120125  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - volný výběr  |d 549-CHOV  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j VV 

Podobné jednotky