Charakterizace a exprese genů kodujících ribozomální RNA u allopolydních růží (Rosa sekce Caninae)

Asymetrická meióza je unikátním jevem pozorovaným u pentaploidních růží šípkových (Rosa sekce Caninae). Během tohoto procesu je jeden bazální genom (x=7), skládající se ze segregujících bivalentů, přenesen do pylu, kdežto zbývající čtyři genomy (4x=28, jeden genom pochází ze segregaci bivalentů a tř...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Crhák Khaitová, Lucie, 1983- (Autor práce)
Další autoři: Kovařík, Aleš, 1960- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2011
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/77874/prif_d/
Obálka
LEADER 06875ctm a22007697a 4500
001 MUB01000696541
003 CZ BrMU
005 20210412120129.0
008 111115s2011 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-02-17 
035 |a (ISMU-VSKP)139439 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 575  |x Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 575.117  |2 MRF 
080 |a 582.711.712  |2 MRF 
100 1 |a Crhák Khaitová, Lucie,  |d 1983-  |7 mub2012691560  |4 dis 
242 1 0 |a Characterization and expression of ribosomal RNA genes in allopolyploid roses (Rosa section Caninae)  |y eng 
245 1 0 |a Charakterizace a exprese genů kodujících ribozomální RNA u allopolydních růží (Rosa sekce Caninae)  |h [rukopis] /  |c Lucie Crhák Khaitová 
260 |c 2011 
300 |a 68 l., [19]s. příl. 
500 |a Vedoucí práce: Aleš Kovařík 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Asymetrická meióza je unikátním jevem pozorovaným u pentaploidních růží šípkových (Rosa sekce Caninae). Během tohoto procesu je jeden bazální genom (x=7), skládající se ze segregujících bivalentů, přenesen do pylu, kdežto zbývající čtyři genomy (4x=28, jeden genom pochází ze segregaci bivalentů a tři genomy z nerekombinujících univalentů) jsou přeneseny do vajíčka. Chromozomy ze všech pěti genomů nesou 18S-5.8S-26S ribozomální DNA (rDNA). Tato práce je zaměřena na charakterizaci, distribuci a expresi jednotlivých vnitřních přepisovaných mezerníků lokusů rDNA (internal transcribed spacer 1, ITS1) u pěti druhů pentaploidních růží (Rosa canina, R. rubiginosa, R. dumalis, R. sherardii, R. caesia) a jednoho druhu tetraploidní růže (R. mollis). Také byla studována dědičnost rDNA u hexaploidních hybridů připravených křížením mateřské pentaploidní R. rubiginosa (přenáší čtyři genomy důsledkem asymetrické meiózy) a otcovské tetraploidní růže R. hybrida 'Andre Brichet' (přenáší dva genomy důsledkem normální meiózy). Sekvencováním ITS1 jsme zjistili že pentaploidní růže nesou pět hlavních rodin rDNA (α, β, γ, δ a ε). U tetraploidní R. mollis se vyskytuje navíc jedna rodina (ω). Analýza exprese genových rodin rRNA ukázala že rodina β se exprimuje nezávisle na druhu. Exprese ostatních rodin rDNA kolísá a některé, například γ a ω, jsou umlčeny. Nezávislým křížením byly připraveny dvě hybridní linie. U mateřské R. rubiginosa jsme detekovali dvě hlavní (β a γ) a jednu vedlejší (δ) rodinu rDNA, oproti tomu otcovská R. hybrida ‘Andre Brichet’ nesla dvě hlavní rodiny (η a θ). Analýza metodou FISH ukázala pokles počtu lokusů pro 35S rDNA z očekávaných šesti na čtyři až pět.  |% cze 
520 2 9 |a Odd or asymmetric meiosis is a unique process found in pentaploid Rosa section Caninae (2n=5x=35). During this process, one basic genome (x=7) formed from segregating bivalents is transmitted to the pollen, and the remaining four genomes (4x=28, one genome is derived from the segregation of the bivalents and three sets from the non-recombining univalents) are transmitted by the egg cell. Chromosomes from all five genomes carry 18S-5.8S-26S ribosomal DNA (rDNA). In this work, we focused on the characterization, distribution and expression of polymorphisms within the internal transcribed spacer1 (ITS1) in five pentaploid (Rosa canina, R. rubiginosa, R. dumalis, R. sherardii, R. caesia) and one tetraploid (R. mollis) dogroses. In addition, we studied the inheritance of rDNA families in hexaploid hybrids obtained from an intersectional cross between pentaploid dogrose R. rubiginosa as a seed parent (transmits four genomes due to asymmetric meiosis) and tetraploid garden rose R. hybria 'Andre Brichet' as a pollen parent (transmits two genomes as in normal symmetric meiosis). Sequencing of the ITS1 region in pentaploid dogroses showed that they carried five major rRNA gene families (α, β, γ, δ and ε), whereas tetraploid R. mollis carried an additional mollis-specific rDNA family referred to as ω. The expression patterns of rRNA gene families showed that β family was always expressed irrespective to species. However, other gene families showed variation in expression and some families (γ and ω) were silenced. In the intersectional cross, the maternal R. rubiginosa carried two major (β and γ) and one minor (δ) ITS families, whereas R. hybrida ‘Andre Brichet’ carried two major families (η and θ) that were not detected in any of the studied species.  |9 eng 
650 0 7 |a genová exprese  |7 ph338530  |2 czenas 
650 0 7 |a polyploidie  |2 czmesh 
650 0 7 |a růže  |7 ph116103  |2 czenas 
650 0 9 |a gene expression  |2 eczenas 
650 0 9 |a roses  |2 eczenas 
650 0 2 |a Polyploidy 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Biologie (čtyřleté)  |b Obecná a molekulární genetika  |c PřF D-BI4 OMG (OMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kovařík, Aleš,  |d 1960-  |7 xx0028286  |% UČO 24426  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/77874/prif_d/ 
CAT |c 20111115  |l MUB01  |h 0422 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0153 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120328  |l MUB01  |h 1234 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120328  |l MUB01  |h 1235 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120410  |l MUB01  |h 1624 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120831  |l MUB01  |h 1006 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20130227  |l MUB01  |h 1055 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1327 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20131210  |l MUB01  |h 1515 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140611  |l MUB01  |h 0739 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140611  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140611  |l MUB01  |h 0741 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1448 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0219 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160126  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a SIMCIKOVAX  |b 02  |c 20170322  |l MUB01  |h 0616 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180814  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181003  |l MUB01  |h 1412 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20191226  |l MUB01  |h 1854 
CAT |c 20200217  |l MUB01  |h 1031 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200218  |l MUB01  |h 0851 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20210412  |l MUB01  |h 1201 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0956 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1945 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1210 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230925  |l MUB01  |h 2011 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-02-17 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11495  |5 3145357306  |8 20130227  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130227  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11495  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD