Bioinformatic analysis and design of haloalkane dehalogenases
Halogenalkandehalogenasy jsou enzymy se širokou substrátovou specificitou, které katalyzují hydrolytický rozklad řady halogenovaných uhlovodíků, včetně významných polutantů životního prostředí. Cílem této práce bylo: (i) rozšířit dosavadní znalosti o halogenalkandehalogenasach o informace týkající s...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2011
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/40707/prif_d/ |
| LEADER | 05290ctm a22007937a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000693895 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20120113125135.0 | ||
| 008 | 111027s2011 xr ||||| |||||||||||eng d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-02-17 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)87463 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 575.112 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.15 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Šebestová, Eva, |d 1980- |7 mub2013800408 |% UČO 179291 |4 dis | |
| 245 | 1 | 0 | |a Bioinformatic analysis and design of haloalkane dehalogenases |h [rukopis] / |c Eva Chovancová |
| 246 | 1 | 1 | |a Bioinformatická analýza a design halogenalkandehalogenas |
| 260 | |c 2011 | ||
| 300 | |a 174 s. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Jiří Damborský | ||
| 502 | |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 | ||
| 520 | 2 | |a Halogenalkandehalogenasy jsou enzymy se širokou substrátovou specificitou, které katalyzují hydrolytický rozklad řady halogenovaných uhlovodíků, včetně významných polutantů životního prostředí. Cílem této práce bylo: (i) rozšířit dosavadní znalosti o halogenalkandehalogenasach o informace týkající se evolučních a funkčních vztahů mezi jednotlivými členy této rodiny a (ii) vyvinout dva bioinformatické nástroje pro racionální design enzymů s vylepšenými katalytickými vlastnostmi. Na základě fylogenetické analýzy byla rodina halogenalkandehalogenas rozdělena do tří podrodin, z nichž jedna nebyla dosud v literatuře pospána. Pro tuto podrodinu byl předpovězen nový typ katalytické pentády. Studie dále zmapovala hlavní evoluční události, které vedly k vývoji současných halogenalkandehalogenas, a to změnu katalytických reziduí a přestavbu víčkové domény. Jako oblast důležitá pro adaptaci halogenalkandehalogenas k novým substrátům byla předpovězena N-koncová část víčkové domény a také ... |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Haloalkane dehalogenases are broad-specificity enzymes catalyzing the hydrolysis of numerous halogenated hydrocarbons, including environmental pollutants. The aim of this Thesis was to: (i) extend the knowledge about this environmentally important family of enzymes by information about the evolutionary and functional relationships among its members and (ii) develop two bioinformatics tools facilitating the rational design of enzymes with improved catalytic properties. Phylogenetic analysis suggested subdivision of haloalkane dehalogenases into three subfamilies, of which one comprised exclusively putative members. A novel type of the catalytic pentad composition was predicted for this new subfamily. The main evolutionary events of haloalkane dehalogenases, i.e., the repositioning of the catalytic pentad residues and the change of the composition of the cap domain, were elucidated. The N-terminal part of the cap domain and the access tunnels were proposed as important sites for ... |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a bioinformatika |7 ph194800 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a enzymy |7 ph119969 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a halogenalkandehalogenasa |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a substrátová specificita |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a bioinformatics |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a enzymes |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a haloalkane dehalogenase |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a substrate specificity |2 eCZ-BrMU |
| 655 | 7 | |a disertace |7 fd132024 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a dissertations |2 eczenas | |
| 658 | |a Chemie (čtyřleté) |b Chemie životního prostředí |c PřF D-CH4 CHZP (CHZP) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Damborský, Jiří, |d 1969- |7 mzk2006348900 |% UČO 1441 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav experimentální biologie |7 mzk2008412438 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/40707/prif_d/ |
| CAT | |c 20111027 |l MUB01 |h 0422 | ||
| CAT | |a VASICEK |b 02 |c 20120113 |l MUB01 |h 1251 | ||
| CAT | |a batch |b 00 |c 20120324 |l MUB01 |h 0152 | ||
| CAT | |c 20120610 |l MUB01 |h 2032 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20121001 |l MUB01 |h 1055 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20130304 |l MUB01 |h 1319 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130925 |l MUB01 |h 1019 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130925 |l MUB01 |h 1137 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20131218 |l MUB01 |h 1042 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20131218 |l MUB01 |h 1043 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20131218 |l MUB01 |h 1050 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20140102 |l MUB01 |h 1712 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140107 |l MUB01 |h 1228 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20140909 |l MUB01 |h 1206 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1448 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1409 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0216 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160829 |l MUB01 |h 1628 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170502 |l MUB01 |h 1655 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170731 |l MUB01 |h 1711 | ||
| CAT | |c 20200217 |l MUB01 |h 1029 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 0956 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1944 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1209 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230920 |l MUB01 |h 0942 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240703 |l MUB01 |h 0129 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-02-17 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-2011-K-8532 |5 3285004130 |8 20120113 |f 70 |f Prezenční |r 20120113 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-2011-K-8532 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||