Využití metod molekulární biologie při detekci bakterií v biologických materiálech
Obecně jsou používána dvě schémata pro bakteriální detekci pomocí zvoleného přístupu. První schéma je založené na sekvenční analýze genu 16S rRNA v DNA vzorku izolovaného přímo z biologického materiálu, což vede k výraznému snížení celkové doby analýzy vzorku. Druhé schéma je založené na přípravě ba...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2010
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/19881/lf_d/ |
| Shrnutí: | Obecně jsou používána dvě schémata pro bakteriální detekci pomocí zvoleného přístupu. První schéma je založené na sekvenční analýze genu 16S rRNA v DNA vzorku izolovaného přímo z biologického materiálu, což vede k výraznému snížení celkové doby analýzy vzorku. Druhé schéma je založené na přípravě bakteriálního izolátu pomocí kultivačních technik a jeho následné identifikaci pomocí sekvenční analýzy16S rRNA. Disertační práce si kladla tři cíle: 1) Zjistit nejčastějšího bakteriálního původce infekční endokarditidy (IE) u klinických vzorků analyzovaných v letech 2003 až 2005 v laboratoři Centra kardiovaskulární a transplantační chirurgie Brno pomocí přímé detekce v biologickém materiálu bez nutnosti provést kultivaci; 2) Aplikovat konvenční širokospektrou 16S rRNA PCR s následnou sekvenční analýzou na identifikaci bakterií v izolátech získaných kultivací z biologických materiálů; a 3) Zavést novou, potenciálně využitelnou, metodu molekulární detekce bakterií. Bakteriální detekce přímo z b Generally, two schemes for bacterial detection according selected approach are used. Fist one is based upon sequence analysis of bacterial isolate obtained by classical microbiological techniques. Second scheme is applied for universal bacterial 16S rRNA detection directly in biological material and without a need for cultivation. The doctoral thesis proposed three goals: 1) to find out the most frequent bacterial pathogen in IE cases of Infective Endocariditis (IE) collected from years 2003 to 2005 at Centre for Cardiovascular Surgery and Transplantations by use of direct detection in biological matrices without a need for bacterial cultivation; 2) to apply conventional broad range 16S rRNA PCR followed with sequence analysis for identification of bacterial isolates obtained by cultivation from biological material; 3) to select a new potentially suitable method from bacterial detection. Broad range detection of 16S rRNA gene was successfully applied. Bacterial detection directly from |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Tomáš Freiberger |
| Fyzický popis: | 66 l. |