Dynamika epigenetických změn transgenních lokusů u Nicotiana tabacum
Tato práce se zabývala studiem dynamiky epigenetických změn transgenního lokusu 1, uspořádaného do obráceného opakování, po zavedení do kalusové kultury, během dlouhodobé kultivace a opětné regenerace rostlinného těla. Dále jsme studovali vliv kalusové kultury na vzájemné interakce mezi homologními...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština Angličtina |
| Vydáno: |
2010
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/67569/prif_d/ |
| Shrnutí: | Tato práce se zabývala studiem dynamiky epigenetických změn transgenního lokusu 1, uspořádaného do obráceného opakování, po zavedení do kalusové kultury, během dlouhodobé kultivace a opětné regenerace rostlinného těla. Dále jsme studovali vliv kalusové kultury na vzájemné interakce mezi homologními transgenními lokusy v hybridních rostlinách, které ve svém genomu obsahovaly posttranskripčně nebo transkripčně umlčený lokus 1 v kombinaci s aktivním transgenním lokusem 2. V úvodní části bylo na základě provedených expresních a metylačních analýz zjištěno, že ke změně epigenetického obrazu transgenního lokusu 1 dochází postupně během kultivace v kalusové kultuře. Studie promotoru lokusu 1 pomocí hydrogensiřičitanového genomového sekvencování navíc odhalila významné zvýšení variability metylačního obrazu mezi jednotlivými analyzovanými klony (reprezentují metylační obraz konkrétních buněk kalusu) v porovnání s rostlinami. Toto zjištění vypovídá o uvolněné regulaci epigenetických modifikací, This work was focused on the study of the dynamics of epigenetic changes in transgenic locus 1, organized as an inverted repeat, in derived cell cultures during the callus culture cultivation and plant regenerants. Further we studied the effect of callus culture on the interactions between homologous transgenic loci in hybrid plants carried either posttranscriptionally or transcriptionally silenced transgenic locus 1 and a homologous transgenic locus 2. In the first part, the expression and methylation analysis revealed that epigenetic changes of transgenic locus 1 occur gradually during callus culture cultivation. Analysis of promoter 35S methylation by bisulfite genomic sequencing showed a marked increase of variability of methylation pattern among analyzed clones (they represent a methylation pattern of individual cells in callus culture) compared to plants. This finding reflects that the regulation of epigenetic modifications in callus culture is relaxed, which is probably caused b |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Aleš Kovařík |
| Fyzický popis: | 61 l., [35] s. příl. |