Metody analýzy proteomu rostlin a jejich využití při studiu role hormonálních regulací
Cytokininy patří k nejdůležitějším rostlinným hormonům ovlivňujícím mnoho aspektů růstu a vývoje rostlin. Přenos cytokininového signálu u Arabidopsis thaliana je vícestupňový přenos fosfátové skupiny (podobný dvoukomponentnímu systému) mezi proteinovými přenašeči do buněčného jádra, kde ovlivňuje tr...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2010
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/269065/prif_b/ |
| Shrnutí: | Cytokininy patří k nejdůležitějším rostlinným hormonům ovlivňujícím mnoho aspektů růstu a vývoje rostlin. Přenos cytokininového signálu u Arabidopsis thaliana je vícestupňový přenos fosfátové skupiny (podobný dvoukomponentnímu systému) mezi proteinovými přenašeči do buněčného jádra, kde ovlivňuje transkripci genů a tedy i expresi proteinů. Studiem souboru proteinů v buňce v daném stavu a čase se zabývá proteomika. Nejvyužívanější separační technikou proteinových směsí je dvourozměrná gelová elektroforéza, která rozděluje proteiny podle dvou nezávislých parametrů, izoelektrického bodu a molekulové hmotnosti. Spoty představující jednotlivé proteiny jsou dále analyzovány hmotnostní spektrometrií a identifikovány porovnáváním hmotnostních spekter a aminokyselinových sekvencí s proteiny v databázích. V této práci jsou shrnuty možné přístupy analýzy změn rostlinného proteomu a je zde navržen postup diferenční analýzy změn fosfoproteomu v odpovědi na hormonální signál Cytokinins belong to the most important plant hormones regulating many aspects of plant growth and development. Cytokinin signal transduction pathway is a multistep phosphorelay (similar to the two-component system) into cellular nucleus between protein transducers where gene transcription is influenced and thus protein expression. Proteomics is the large-scale study that deals with complete complement of proteins. The most common method for separation of protein mixtures is known as two-dimensional gel electrophoresis that separates proteins according two independent parameters, isoelectric point and molecular mass. Spots representing individual proteins are further analyzed by mass spectrometry and identified by comparison of mass spectra and amino acid sequences with proteins in databases. This thesis summarizes possible approaches to analyze of changes in the plant proteome and also contains an experimental design of differential analysis of phosphoproteome changes in a response to |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Jan Hejátko |
| Fyzický popis: | 43 l. |