Komparativní genomika Treponema pallidum : cesta od určení sekvence chromozomu k aplikacím v klinické diagnostice /

Druh Treponema pallidum zahrnuje 3 pro člověka patogenní poddruhy. Tyto poddruhy - pallidum, pertenue a endemicum - způsobují přes velice blízkou sekvenční příbuznost onemocnění s odlišnou klinickou manifestací. Jedná se o syfilis, yaws a endemickou syfilis. Patogenní treponemata zahrnují ovšem i pa...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Pospíšilová, Petra (Autor práce)
Další autoři: Šmajs, David, 1969- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2009
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/12972/lf_d/
Obálka
LEADER 07364ctm a22012857a 4500
001 MUB01000622485
003 CZ BrMU
005 20231128113443.0
008 100409s2009 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-05-22 
035 |a (ISMU-VSKP)72971 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD002 
072 7 |a 575  |x Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce  |2 Konspekt  |9 2 
072 7 |a 616  |x Patologie. Klinická medicína  |2 Konspekt  |9 14 
080 |a 616.972  |2 MRF 
080 |a 575.111  |2 MRF 
080 |a 575  |2 MRF 
080 |a 616  |2 MRF 
100 1 |a Pospíšilová, Petra  |% UČO 12972  |* [absolvent PřírF a LF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Comparative genomics of Treponema pallidum :  |b from whole genome sequencing to diagnostic applications  |y eng 
245 1 0 |a Komparativní genomika Treponema pallidum :  |h [rukopis]  |b cesta od určení sekvence chromozomu k aplikacím v klinické diagnostice /  |c Petra Pospíšilová 
260 |c 2009 
300 |a 100 l. 
500 |a Vedoucí práce: David Šmajs. 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Lékařská fakulta, 2009. 
520 2 |a Druh Treponema pallidum zahrnuje 3 pro člověka patogenní poddruhy. Tyto poddruhy - pallidum, pertenue a endemicum - způsobují přes velice blízkou sekvenční příbuznost onemocnění s odlišnou klinickou manifestací. Jedná se o syfilis, yaws a endemickou syfilis. Patogenní treponemata zahrnují ovšem i patogeny jiných hostitelů než člověka. Jedná se o druhově nezařazený opičí izolát Fribourg-Blanc a druh T. paraluiscuniculi. Kmen Fribourg Blanc způsobuje u opic onemocnění podobné treponematóze yaws a druh T. paraluiscuniculi je původcem venerické spirochetózy králíků. Jmenované patogeny nelze morfologicky ani serologicky odlišit a jejich genomy vykazují nezvykle vysokou sekvenční identitu (99 a víc %). V současné době je známo velmi málo o genetické variabilitě na úrovni srovnání celých genomů popsané skupiny treponemat. Metoda komparativního genomového sekvenování byla použita pro určení sekvence chromozomu Treponema pallidum subsp. pallidum kmene SS14. K vyhledání sekvenčně divergentních o.  |% cze 
520 2 9 |a Genus Treponema includes several pathogenic spirochetes. Three human pathogens include: Treponema pallidum ssp. pallidum, the causative agent of venereal syphilis; T. pallidum ssp. pertenue, the causative agent of yaws; and T. pallidum ssp. endemicum causing endemic syphilis. Non-human pathogens include: unclassified simian isolate Fribourg-Blanc and T. paraluiscuniculi. Fribourg-Blanc strain causes infections similiar to yaws in primates and T. paraluiscuniculi causes venereal spirochetosis in rabbits. All these pathogenic agents are morphologically and serologically indistinguishable and their genomes show unusual degree of sequence similarity (99% or higher identity). In fact, very little is known about the genetic differences on the whole genome scale in the group of pathogenic treponemes. Comparative genome sequencing strategy (CGS) was employed to sequence the bacterium Treponema pallidum ssp. pallidum strain SS14. Genomic DNA hybridization to a dense oligonucleotide tiling arra.  |9 eng 
650 0 7 |a frambézie  |2 czmesh 
650 0 7 |a klinická diagnostika  |7 ph114915  |2 czenas 
650 0 7 |a komparativní genomika  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a syfilis  |x diagnóza  |2 czmesh 
650 0 7 |a Treponema pallidum  |x genetika  |2 czmesh 
650 0 9 |a Comparative genomics  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a clinical diagnostics  |2 eczenas 
650 0 2 |a syfilis 
650 0 2 |a Treponema pallidum 
650 0 2 |a Yaws 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
658 |a Lékařská biologie (čtyřleté)  |b Lékařská biologie  |c LF D-LB4 LBIO (LBIO)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Šmajs, David,  |d 1969-  |7 xx0061318  |% UČO 1116  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Biologický ústav  |7 xx0044574  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/12972/lf_d/ 
CAT |c 20100409  |l MUB01  |h 1119 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20100409  |l MUB01  |h 1139 
CAT |c 20100428  |l MUB01  |h 1015 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20100501  |l MUB01  |h 1234 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20100524  |l MUB01  |h 1535 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20100617  |l MUB01  |h 0410 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20100809  |l MUB01  |h 2359 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20100929  |l MUB01  |h 0337 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20110126  |l MUB01  |h 2237 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 1918 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 2327 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0137 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2004 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120712  |l MUB01  |h 1255 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20121217  |l MUB01  |h 0939 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130211  |l MUB01  |h 1338 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1040 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130409  |l MUB01  |h 1256 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130409  |l MUB01  |h 1257 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130410  |l MUB01  |h 0752 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140115  |l MUB01  |h 0857 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140311  |l MUB01  |h 1037 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140611  |l MUB01  |h 1220 
CAT |a NEDOMOVAX  |b 02  |c 20140708  |l MUB01  |h 2231 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140814  |l MUB01  |h 0759 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150804  |l MUB01  |h 1804 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1445 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1406 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20151216  |l MUB01  |h 1034 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0059 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160419  |l MUB01  |h 0735 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160510  |l MUB01  |h 1235 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160731  |l MUB01  |h 2236 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20170418  |l MUB01  |h 1308 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0006 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20171025  |l MUB01  |h 1014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180320  |l MUB01  |h 1004 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180502  |l MUB01  |h 0758 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181010  |l MUB01  |h 0810 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181213  |l MUB01  |h 0828 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190327  |l MUB01  |h 1236 
CAT |c 20190522  |l MUB01  |h 1122 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190716  |l MUB01  |h 0804 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200218  |l MUB01  |h 0905 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200615  |l MUB01  |h 0629 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200913  |l MUB01  |h 1229 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200913  |l MUB01  |h 1821 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201126  |l MUB01  |h 0108 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210106  |l MUB01  |h 0153 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0946 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1935 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210813  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220316  |l MUB01  |h 2245 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220316  |l MUB01  |h 2245 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220807  |l MUB01  |h 0140 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230222  |l MUB01  |h 0027 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230222  |l MUB01  |h 0027 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230808  |l MUB01  |h 2056 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231012  |l MUB01  |h 2055 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20231128  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231204  |l MUB01  |h 1957 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231211  |l MUB01  |h 0133 
CAT |c 20251004  |l MUB01  |h 0107 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-05-22 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 LF-2009-K-7301  |6 3147040764  |5 3147040764  |4 DISP.: LF  |8 20100219  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20100219  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d LF-2009-K-7301  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 1  |j SKLAD