PCR-RFLP assay for detection and species identification on fungal pathogens and its possible applications in clinical practice
Byla vyvinuta rychlá a citlivá PCR-RFLP metoda pro detekci a identifikaci patogenních mikromycet a možnost její aplikace byla testována na klinickém materiálu leukemických pacientů s febrilní neutropenií, chlopních pacientů s infekční endokarditidou a u pacienta s konstriktivní perikarditidou. Byly...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2007.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/8517/prif_r/ |
| LEADER | 04957ctm a22006857a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000550362 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20160504153546.0 | ||
| 008 | 080527s2007 xr ||||| |||||||||||eng d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2017-06-28 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)141976 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD004 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 577.21 |2 MRF | ||
| 080 | |a 578/579 |2 MRF | ||
| 080 | |a 616-092 |2 MRF | ||
| 080 | |a (043.2) |2 MRF | ||
| 080 | |a 577 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Dendis, Miloš |7 xx0063728 |% UČO 8517 |4 dis | |
| 245 | 1 | 0 | |a PCR-RFLP assay for detection and species identification on fungal pathogens and its possible applications in clinical practice |h [rukopis] / |c Miloš Dendis |
| 246 | 3 | 1 | |a Detekce a identifikace patogenních mikromycet metodou PCR-RFLP a možné aplikace v klinické praxi |
| 260 | |c 2007. | ||
| 300 | |a 54 l., [22] s. příl. : |b il. | ||
| 502 | |a Rigorózní práce (RNDr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2007 | ||
| 520 | 2 | |a Byla vyvinuta rychlá a citlivá PCR-RFLP metoda pro detekci a identifikaci patogenních mikromycet a možnost její aplikace byla testována na klinickém materiálu leukemických pacientů s febrilní neutropenií, chlopních pacientů s infekční endokarditidou a u pacienta s konstriktivní perikarditidou. Byly analyzovány houbové, ribosomální ITS2 sekvence 42 patogenních mikromycet a do konzervativních oblastí navrženy primery umožňující detekci těchto mikromycet v jedné PCR reakci. Pro druhovou a rodovou identifikaci patogenních mikromycet bylo využito analýzy polymorfismu délky amplifikačních produktů (APLP) a polymorfismu délky restrikčních fragmentů (RFLP). Specificita a reprodukovatelnost této metody byla testována na 316 kmenech 42 druhů mikromycet. Citlivost detekce prezentované metody byla kolem 3 buněk Candida albicans v 1 ml krve a výsledky detekce a identifikace mikromycet z klinického materiálu byly k dispozici do 8 hodin od odběru vzorku. Pomocí této metody byla houbová DNA deteková |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a A rapid and sensitive PCR-based assay for detection and identification of fungal pathogens was designed and applicability of this method was investigated in a group of children with cancer and febrile neutropenia (FN), group of the patients with culture negative infection endocarditis (IE) and patient with pericardial constriction caused by Candida albicans. The ITS2 sequences and adjacent regions of 42 fungal pathogens were analyzed and primers for detection of all analyzed fungal species were designed. Amplification product length polymorphism (APLP) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) generated genus- or species- specific patterns. The specificity of the method was tested on 316 strains of 42 fungal species. The sensitivity of the method was about 3 cells of Candida albicans per 1 ml of blood. The results were available within 8 hours after sample collection. The PCR assay detected fungal DNA in twenty-five clinical samples from 10 leukemic patients with FN, three pa |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a molekulární genetika |7 ph122957 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a patogenní mikroorganismy |7 ph115692 |2 czenas |
| 650 | 0 | 9 | |a molecular genetics |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a pathogenic microorganisms |2 eczenas |
| 655 | 7 | |a rigorózní práce |7 fd132407 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a doctoral dissertations |2 eczenas | |
| 658 | |a Biologie |b Molekulární biologie a genetika |c PřF Rig-BI BIMG (BIMG) |2 CZ-BrMU | ||
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav experimentální biologie |7 mzk2008412438 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/8517/prif_r/ |
| CAT | |a DRIMLOVA |b 02 |c 20080527 |l MUB01 |h 1009 | ||
| CAT | |a DRIMLOVA |b 02 |c 20080528 |l MUB01 |h 0903 | ||
| CAT | |a JANA |b 02 |c 20080626 |l MUB01 |h 1553 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20091102 |l MUB01 |h 0645 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20091103 |l MUB01 |h 0148 | ||
| CAT | |c 20091203 |l MUB01 |h 0211 | ||
| CAT | |c 20091203 |l MUB01 |h 1854 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 00 |c 20091219 |l MUB01 |h 0755 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 00 |c 20100501 |l MUB01 |h 1154 | ||
| CAT | |a PUTNOVAX |b 02 |c 20110309 |l MUB01 |h 1420 | ||
| CAT | |a batch |b 00 |c 20120324 |l MUB01 |h 0114 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120412 |l MUB01 |h 0942 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120412 |l MUB01 |h 0947 | ||
| CAT | |c 20120610 |l MUB01 |h 1923 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20130303 |l MUB01 |h 1005 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151225 |l MUB01 |h 2331 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160504 |l MUB01 |h 1535 | ||
| CAT | |c 20170628 |l MUB01 |h 1104 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 0932 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1921 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1136 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2017-06-28 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-K-11564 |5 3145342222 |8 20080527 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20080527 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-K-11564 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||