Optimized and parallelized implementation of the electronegativity equalization method and the atom-bond electronegativity equalization method

Nejčastěji používanými metodami pro výpočet náboje atomů v rámci molekuly jsou ab-initio kvantově mechanické metody. V nedávné době byly vyvinuty rychlejší metody pro výpočet náboje - eqalizační metody EEM (electronegativity equalization method) a ABEEM (atom-bond electronegativity equalization meth...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Svobodová Vařeková, Radka, 1977- (Autor práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2006.
Témata:
atom-bond electronegativity equalization method
electronegativity equalization method
molekuly
molecules
rigorózní práce
doctoral dissertations
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/4056/prif_r/
Obálka
LEADER 05322ctm a22008417a 4500
001 MUB01000456321
003 CZ BrMU
005 20070207111240.0
008 060530s2006 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2012-03-06 
035 |a (ISMU-VSKP)119476 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 544  |x Fyzikální chemie  |2 Konspekt  |9 10 
080 |a 544.112-122  |2 MRF 
080 |a (043.2)  |2 MRF 
080 |a 544  |2 MRF 
100 1 |a Svobodová Vařeková, Radka,  |d 1977-  |7 mub2010609307  |% UČO 4056  |4 dis 
245 1 0 |a Optimized and parallelized implementation of the electronegativity equalization method and the atom-bond electronegativity equalization method  |h [rukopis] /  |c Radka Svobodová Vařeková. 
260 |c 2006. 
300 |a 89 l. 
502 |a Rigorózní práce (RNDr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2006. 
520 2 |a Nejčastěji používanými metodami pro výpočet náboje atomů v rámci molekuly jsou ab-initio kvantově mechanické metody. V nedávné době byly vyvinuty rychlejší metody pro výpočet náboje - eqalizační metody EEM (electronegativity equalization method) a ABEEM (atom-bond electronegativity equalization method), které jsou založeny na DFT (density functional theory). V této práci byly metody EEM a ABEEM implementovány a optimalizovány, přičemž byly vytvořeny programy EEM SOLVER a ABEEM SOLVER. Tyto programy byly otestovány a bylo ověřeno, že jejich výsledky dosahují požadované přesnosti a že jsou výrazně rychlejší než ab-initio metody. Bylo zjištěno, že nejvíce časově náročnou částí equalizačních metod je redukce matice soustavy rovnic, vygenerované při výpočtu. Z tohoto důvodu byla uvedená část algoritmu nahrazena paralelním algoritmem a implementována pomocí PVM (parallel virtual machine).  |% cze 
520 2 9 |a The most common way to calculate charge distribution in a molecule is ab-initio quantum mechanics. Some faster alternatives to quantum mechanics have also been developed, so called equalization methods EEM (electronegativity equalization method) and ABEEM (atom-bond electronegativity equalization method), which are based on density functional theory. In this work, the EEM and ABEEM methods were implemented and optimized and the EEM SOLVER and ABEEM SOLVER programs were developed. These programs were tested and it was verified that they have adequate accuracy and are markedly faster than ab-initio methods. It has been found that the most time-consuming part of equalization methods is the reduction of the matrix belonging to the equation system generated by the method. Therefore, for both methods this part was replaced by the parallel algorithm and implemented within the parallel virtual machine environment.  |9 eng 
650 0 7 |a atom-bond electronegativity equalization method  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a electronegativity equalization method  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a molekuly  |7 ph122950  |2 czenas 
650 0 9 |a molecules  |2 eczenas 
655 7 |a rigorózní práce  |7 fd132407  |2 czenas 
655 9 |a doctoral dissertations  |2 eczenas 
658 |a Chemie  |b Fyzikální chemie  |c PřF Rig-CH FCHE (FCHE)  |2 CZ-BrMU 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Katedra teoretické a fyzikální chemie  |7 kn20020321071  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/4056/prif_r/ 
CAT |c 20060530  |l MUB01  |h 0929 
CAT |a CONV-M53  |b 02  |c 20061206  |l MUB01  |h 2000 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20070117  |l MUB01  |h 1502 
CAT |a VARTECKA  |b 02  |c 20070207  |l MUB01  |h 1112 
CAT |c 20070427  |l MUB01  |h 2155 
CAT |c 20071003  |l MUB01  |h 2201 
CAT |c 20080429  |l MUB01  |h 1812 
CAT |c 20080429  |l MUB01  |h 1826 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20090923  |l MUB01  |h 1458 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20091102  |l MUB01  |h 0534 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20091103  |l MUB01  |h 0057 
CAT |c 20091203  |l MUB01  |h 0122 
CAT |c 20091203  |l MUB01  |h 1802 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20091219  |l MUB01  |h 0716 
CAT |c 20100428  |l MUB01  |h 0944 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20100501  |l MUB01  |h 1058 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20100929  |l MUB01  |h 0302 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20101111  |l MUB01  |h 1035 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20101213  |l MUB01  |h 1318 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20111019  |l MUB01  |h 1046 
CAT |c 20120306  |l MUB01  |h 1335 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0046 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 1814 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120718  |l MUB01  |h 1429 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130303  |l MUB01  |h 0733 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140212  |l MUB01  |h 1326 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1210 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1427 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1348 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151224  |l MUB01  |h 1109 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20180806  |l MUB01  |h 1723 
CAT |a PTICHAX  |b 02  |c 20210131  |l MUB01  |h 1332 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0916 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1905 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1111 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240202  |l MUB01  |h 2101 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2012-03-06 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-9217  |5 3145334450  |8 20070117  |f 70  |f Prezenční  |r 20070117  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-9217  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky