Characterization of interferon inducible protein 16 and its DNA binding properties /

DNA se vyskytuje zejména ve formě B-DNA, avšak může nabývat i jiných struktur. Různorodost struktury DNA rozšiřuje možnosti rozpoznávání DNA proteiny a právě lokální struktury DNA byly ukázány jako klíčové komponenty mnoha buněčných regulací. Tato práce pojednává o proteinu IFI16 (Interferon gamma i...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Hároníková, Lucia (Autor práce)
Další autoři: Brázda, Václav, 1970- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2016
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/269008/prif_d/
Obálka
LEADER 06327ctm a22010337i 4500
001 MUB01006375419
003 CZ BrMU
005 20190703070603.0
008 160913s2016 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-03-13 
035 |a (ISMU-VSKP)232781 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.212.3  |2 MRF 
080 |a 577.112  |2 MRF 
080 |a 543.552  |2 MRF 
100 1 |a Hároníková, Lucia  |7 xx0228692  |% UČO 269008  |4 dis 
242 1 0 |a Charakterizace interferon inducibilního proteinu 16 a jeho vazebných vlastností k DNA  |y cze 
245 1 0 |a Characterization of interferon inducible protein 16 and its DNA binding properties /  |c Lucia Hároníková 
264 0 |c 2016 
300 |a 52 listů, přílohy v různém stránkování :  |b ilustrace 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Václav Brázda 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2016 
520 2 |a DNA se vyskytuje zejména ve formě B-DNA, avšak může nabývat i jiných struktur. Různorodost struktury DNA rozšiřuje možnosti rozpoznávání DNA proteiny a právě lokální struktury DNA byly ukázány jako klíčové komponenty mnoha buněčných regulací. Tato práce pojednává o proteinu IFI16 (Interferon gamma inducibilní protein 16), DNA senzoru odpovědném za vrozenou imunitní odpověď, transkripční regulaci a interakčním partneru s regulačními proteiny, například p53 a BRCA1. Zaměřili jsme se na charakterizaci interakcí IFI16 s DNA s důrazem na lokální struktury DNA, zejména kvadruplexovou DNA. Ukázali jsme preferenční vazbu IFI16 na kvadruplexy a taktéž stabilizační efekt proteinu na formování kvadruplexu. V našem review jsme popsali interakce kvadruplexové DNA s proteiny a zdůraznili jsme význam těchto interakcí v buněčných regulacích. Za použití voltametrické detekce jsme navrhli jednoduchý systém detekce produktu PCR, který může být použit ke sledování exprese genu nebo sledování delece genu.  |% cze 
520 2 9 |a DNA is generally folded into B-DNA form however it can adopt other different structures. The DNA structure variability enlarges the possibility of recognition patterns for DNA-protein interactions and the local DNA structures were showed to play an important role in regulation of cellular processes. This work is dedicated to IFI16 protein (Interferon gamma inducible protein 16), a DNA sensor responsible for the innate immunity response, transcriptional regulator of various genes and an interacting partner with important regulatory proteins, for example p53 and BRCA1. We focused on characterization of IFI16 - DNA interaction with emphasis on the local DNA structures, notably the quadruplex DNA. We showed the IFI16’s preference for quadruplex DNA and also the stabilization effect of IFI16 on the quadruplex formation. In our review, we described the protein-quadruplex interactions and stressed their importance in cell regulation. By using voltammetric detection, we proposed an easy approa  |9 eng 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a G-kvadruplexy  |2 czmesh 
650 0 7 |a interakce protein-DNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a křížová struktura DNA  |2 czmesh 
650 0 7 |a multiplexová polymerázová řetězová reakce  |2 czmesh 
650 0 7 |a struktura DNA  |7 ph195811  |2 czenas 
650 0 7 |a voltametrie  |7 ph394396  |2 czenas 
650 0 9 |a DNA structure  |2 eczenas 
650 0 9 |a protein-DNA interaction  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a voltammetry  |2 eczenas 
650 0 2 |a DNA, Cruciform 
650 0 2 |a G-Quadruplexes 
650 0 2 |a Multiplex Polymerase Chain Reaction 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Biochemie (čtyřleté)  |b Biochemie  |c PřF D-BCH4 BIOCH (BIOCH)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Brázda, Václav,  |d 1970-  |7 nlk20010096077  |% UČO 15548  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/269008/prif_d/ 
CAT |c 20160913  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160914  |l MUB01  |h 1411 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160914  |l MUB01  |h 1417 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160919  |l MUB01  |h 1405 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20170214  |l MUB01  |h 1319 
CAT |c 20170313  |l MUB01  |h 1031 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170727  |l MUB01  |h 1508 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1609 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1615 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1623 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1816 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2034 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0152 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0209 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0735 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1139 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1437 
CAT |a VARTECKAX  |b 02  |c 20190703  |l MUB01  |h 0706 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210204  |l MUB01  |h 2057 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1020 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2007 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1248 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230313  |l MUB01  |h 1621 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231027  |l MUB01  |h 2116 
CAT |c 20240209  |l MUB01  |h 1157 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0000 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0003 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-03-13 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-13834  |5 3285012288  |8 20170214  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20170214  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-13834  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD