Vliv přítomnosti TRF2 na funkci jiných DNA vazebných proteinů

Telomery jsou nukleoproteinové struktury na koncích eukaryotických chromozomů. Telomerickou DNA tvoří tandemové repetice se sekvencí 5‘-TTAGGG-3’. Telomery jsou chráněny proteinovým komplexem nazývaným shelterin. Shelterin se skládá ze šesti podjednotek. Centrální roli v shelterinu hraje protein TRF...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Hluchý, Milan (Autor práce)
Další autoři: Hofr, Ctirad, 1974- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/357323/prif_m/
Obálka
LEADER 05398ctm a22008057a 4500
001 MUB01001001410
003 CZ BrMU
005 20210510144515.0
008 140627s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
035 |a (ISMU-VSKP)237347 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.112  |2 MRF 
100 1 |a Hluchý, Milan  |% UČO 357323  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Effects of protein TRF2 on function of other DNA binding proteins  |y eng 
245 1 0 |a Vliv přítomnosti TRF2 na funkci jiných DNA vazebných proteinů  |h [rukopis] /  |c Milan Hluchý 
260 |c 2014 
300 |a 76 l. 
500 |a Vedoucí práce: Ctirad Hofr 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a Telomery jsou nukleoproteinové struktury na koncích eukaryotických chromozomů. Telomerickou DNA tvoří tandemové repetice se sekvencí 5‘-TTAGGG-3’. Telomery jsou chráněny proteinovým komplexem nazývaným shelterin. Shelterin se skládá ze šesti podjednotek. Centrální roli v shelterinu hraje protein TRF2. Protein TRF2 je DNA-vazebný protein, který koordinuje proteiny účastnící se správného fungování telomer. Jednou z netelomerických funkcí proteinu TRF2 je ochrana proteinu REST před polyubikvitinací a degradací v proteazomu. Aktivní protein REST se nachází v promotorech genů souvisejících s diferenciací a dozráváním neuronů a epigeneticky je umlčuje. Cílem této práce byla identifikace domén, které jsou zodpovědné za interakci mezi proteiny TRF2 a REST. Zkrácené verze obou proteinů byly vloženy do dvou různých vektorů a jejich exprese v buňkách E. coli byla optimalizována. Purifikované proteiny byly použity v in vitro studiích, konkrétně v pull-down pokusech a měřeních SPR (z angl. Surface  |% cze 
520 2 9 |a Telomeres are nucleoprotein structures found at the ends of eukaryotic chromosomes. Telomeric DNA consists of tandem repetitions with 5‘-TTAGGG-3’ sequence. Telomeres are protected by a protein complex called shelterin. Shelterin complex consists of six subunits. Central role on shelterin is played by TRF2 protein. TRF2 is a DNA-binding protein that acts as a scaffold for multiple proteins which are important for proper functions of telomeres. One of several non-telomeric functions of TRF2 is the protection of REST protein from polyubiquitination and proteasomal degradation. Active REST proteins are found in promoters of genes linked to differentiation and maturation of neurons and is epigenetically silencing them. This work focuses on identification of the domains responsible for TRF2-REST interaction. Truncated versions of both proteins were cloned into different vectors and their expressions in E. coli cells were optimized. Purified proteins were used for in vitro studies, namely pu  |9 eng 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Experimentální biologie  |b Molekulární biologie a genetika  |c PřF N-EXB BIMG (BIMG)  |2 CZ-BrMU 
650 0 2 |a Repressor Proteins 
650 0 2 |a Telomere-Binding Proteins 
650 0 2 |a Telomeric Repeat Binding Protein 2 
650 0 7 |a protein REST  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a proteiny vázající telomery  |2 czmesh 
650 0 7 |a protein TRF2  |2 czmesh 
650 0 7 |a represorové proteiny  |2 czmesh 
650 0 7 |a shelterin  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Hofr, Ctirad,  |d 1974-  |7 xx0074131  |% UČO 7807  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie.  |b Oddělení genetiky a molekulární biologie  |7 mub20211111509  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/357323/prif_m/ 
CAT |c 20140627  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20140702  |l MUB01  |h 1119 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140808  |l MUB01  |h 1428 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1614 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1109 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1331 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1332 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150806  |l MUB01  |h 1700 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1452 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0503 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161219  |l MUB01  |h 1600 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170901  |l MUB01  |h 1541 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20180321  |l MUB01  |h 1815 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1416 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1458 
CAT |c 20200306  |l MUB01  |h 1847 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201102  |l MUB01  |h 0055 
CAT |c 20210121  |l MUB01  |h 1011 
CAT |c 20210208  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20210510  |l MUB01  |h 1445 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1010 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1957 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1230 
CAT |c 20230310  |l MUB01  |h 1117 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230920  |l MUB01  |h 2220 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231106  |l MUB01  |h 1705 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240409  |l MUB01  |h 2331 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240409  |l MUB01  |h 2332 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-9715  |6 3285006662  |5 3285006662  |8 20140702  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20140702  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-9715  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD