Characterization of protein modifications by mass spectrometry

Pokroky v metodice pro charakterizaci post-translačních modifikací hmotnostní spektrometrii umožnily podrobnější studium různých biologických problémů. Tato disertační práce je věnována charakterizaci tří typů post-translačních modifikací ve spojení s jednotlivými výzkumnými problémy, zejména pak za...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Šedová, Kateřina, 1985- (Autor práce)
Další autoři: Zdráhal, Zbyněk, 1965- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/151266/prif_d/
Obálka
LEADER 05031ctm a22007457a 4500
001 MUB01000998907
003 CZ BrMU
005 20141218100046.0
008 140612s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-12-14 
035 |a (ISMU-VSKP)179765 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 543.51  |2 MRF 
080 |a 577.1  |2 MRF 
100 1 |a Šedová, Kateřina,  |d 1985-  |7 mub2014828227  |% UČO 151266  |4 dis 
245 1 0 |a Characterization of protein modifications by mass spectrometry  |h [rukopis] /  |c Kateřina Šedová 
260 |c 2014 
300 |a 87 l., [55] l. příl. 
500 |a Vedoucí práce: Zbyněk Zdráhal 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a Pokroky v metodice pro charakterizaci post-translačních modifikací hmotnostní spektrometrii umožnily podrobnější studium různých biologických problémů. Tato disertační práce je věnována charakterizaci tří typů post-translačních modifikací ve spojení s jednotlivými výzkumnými problémy, zejména pak zavedení metodiky nezbytné pro jejich studium. Řešení prvního problému, týkajícího se detailního popisu acetylačních variant histonů a vlivu inhibitorů histonových deacetyláz na přítomnost a distribuci těchto variant, vyžadovalo použití kapalinové chromatografie a speciální MS/MS fragmentační metody. Druhá studie byla zaměřena na charakterizaci ubiquitinací proteinu Dishevelled, a bylo v ní využito specifické protilátky a speciálního režimu záznamu MS dat umožňujícího detekci maximálního počtu modifikovaných peptidů. Třetí téma bylo zaměřeno na analýzu fosforylací proteinu Dishevelled v závislosti na testovaných podmínkách. Tato práce zahrnovala afinitní frakcionaci pomocí oxidu ...  |% cze 
520 2 9 |a Advances in mass spectrometric characterization of post-translational modifications enable application of these analytical methods on variety of biological problems. This thesis involves implementation of methods for characterization of three types of post-translational modifications in connection with individual research projects. In the first case, liquid chromatography and special MS/MS fragmentation methods for parallel and more detailed description of histone acetylation patterns after treatment with histone deacetylase inhibitors was employed. The second study was focused on characterization of ubiquitylation including usage of specific antibodies and data acquisition scheme allowing detection of maximum of modified peptides. The third theme was focused on analysis of Dishevelled protein phosphorylation status upon different conditions. This work involved TiO2 affinity fractionation, mass spectrometry analysis in data-dependent manner and extensive evaluation of output data.  |9 eng 
650 0 7 |a acetylace  |2 czmesh 
650 0 7 |a fosforylace  |2 czmesh 
650 0 7 |a hmotnostní spektrometrie  |7 ph120763  |2 czenas 
650 0 7 |a posttranslační úpravy proteinů  |2 czmesh 
650 0 7 |a ubikvitinace  |2 czmesh 
650 0 9 |a mass spectroscopy  |2 eczenas 
650 0 2 |a Acetylation 
650 0 2 |a Phosphorylation 
650 0 2 |a Protein Processing, Post-Translational 
650 0 2 |a Ubiquitination 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Biochemie (čtyřleté)  |b Genomika a proteomika  |c PřF D-BCH4 GEPR (GEPR)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Zdráhal, Zbyněk,  |d 1965-  |7 xx0074482  |% UČO 34759  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/151266/prif_d/ 
CAT |c 20140612  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140616  |l MUB01  |h 1502 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140703  |l MUB01  |h 0830 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1432 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1614 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1108 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141113  |l MUB01  |h 0650 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141113  |l MUB01  |h 0703 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20141210  |l MUB01  |h 1049 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20141218  |l MUB01  |h 1000 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150803  |l MUB01  |h 1743 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1452 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20151006  |l MUB01  |h 1034 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0459 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160906  |l MUB01  |h 1539 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170814  |l MUB01  |h 1733 
CAT |c 20201214  |l MUB01  |h 1120 
CAT |c 20210121  |l MUB01  |h 1011 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1009 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1957 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1229 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-12-14 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-12382  |5 3285007385  |8 20141218  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20141218  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-12382  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD