Komparativní genomika nekultivovatelných patogenních treponemat: identifikace genetických rozdílů mezi původci syfilis a yaws
Rod Treponema zahrnuje několik blízce příbuzných nekultivovatelných zástupců. Kromě lidských patogenů, původců syfilis a endemických treponematóz, jsou to také původci onemocnění u zvířat. Tyto zástupce rodu Treponema nelze běžně používanými metodami morfologickými, imunologickými ani serologickými...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2012
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/177725/lf_d/ |
| Shrnutí: | Rod Treponema zahrnuje několik blízce příbuzných nekultivovatelných zástupců. Kromě lidských patogenů, původců syfilis a endemických treponematóz, jsou to také původci onemocnění u zvířat. Tyto zástupce rodu Treponema nelze běžně používanými metodami morfologickými, imunologickými ani serologickými od sebe odlišit. Jednotlivé druhy a poddruhy se odlišují na základě epidemiologických charakteristik a rozdílné klinické manifestace onemocnění. Ovšem mechanismy jejich patogeneze ani virulence stále nejsou přesně objasněny. Jejich genomy vykazují velkou sekvenční podobnost. Metodou „whole genome fingerprinting“ byla zjištěna více než 99,5% identita mezi genomy poddruhů T. p. pallidum a T. p. pertenue. Příčinou rozdílné klinické manifestace obou onemocnění jsou tedy relativně malé genetické rozdíly mezi oběma poddruhy. V rámci dizertační práce byl proto sekvenován genom kmene T. p. subsp. pertenue Samoa D s využitím celogenomových sekvenačních metod pyrosekvenování, technologie Illumina a ko The genus Treponema contains several closely related uncultivable pathogenic species and subspecies. Strains of this group are causative agents of human treponemal diseases syphilis, endemic syphilis, yaws and pinta. Strains of this group are also causative agents of treponemal infection in primates, venereal spirochetosis in rabbits and similar disease in hares. The pathogenic Treponema are indistinguishable in terms of morphology, immunology and serological tests. Treponemal species and subspecies are therefore differentiated based on different epidemiological and clinical manifestations. Mechanisms of treponemal pathogenesis and virulence are still not clear. Whole genome fingerprinting method reavealed more than 99,5% identity between genomes of T. p. subsp. pallidum and T. p. subsp. pertenue. Therefore, only relatively small genetic differences between these two subspecies are responsible for different clinical manifestations of both diseases. My work partly focused on sequencing |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: David Šmajs |
| Fyzický popis: | 103 l. + 1 CD-ROM |