Struktura, funkce a evoluce halogenalkandehalogenas

Halogenalkandehalogenasy jsou enzymy, které katalyzují hydrolytický rozklad řady halogenovaných uhlovodíků. Tyto enzymy jsou často používány jako modelové systémy pro výzkum základních principů enzymové katalýzy a díky svým vlastnostem také nabízí řadu potenciálních praktických aplikací. První část...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Harnoš, Jakub (Dissertant)
Other Authors: Šebestová, Eva, 1980- (Thesis advisor)
Format: Thesis Manuscript
Language:Czech
Published: 2011
Subjects:
Online Access:http://is.muni.cz/th/324015/prif_b/
Cover Image
LEADER 05054ctm a22007097a 4500
001 MUB01000682140
003 CZ BrMU
005 20191025230034.0
008 110624s2011 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
035 |a (ISMU-VSKP)207741 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.15  |2 MRF 
080 |a 577.152.1  |2 MRF 
080 |a 577.2-051  |2 MRF 
100 1 |a Harnoš, Jakub  |% UČO 324015  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Structure, function and evolution of haloalkane dehalogenases  |y eng 
245 1 0 |a Struktura, funkce a evoluce halogenalkandehalogenas  |h [rukopis] /  |c Jakub Harnoš 
246 1 |i Název v IS MU:  |a Struktura, funkce a evoluce halogenalkandehalogenáz 
260 |c 2011 
300 |a 40 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Eva Chovancová 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Halogenalkandehalogenasy jsou enzymy, které katalyzují hydrolytický rozklad řady halogenovaných uhlovodíků. Tyto enzymy jsou často používány jako modelové systémy pro výzkum základních principů enzymové katalýzy a díky svým vlastnostem také nabízí řadu potenciálních praktických aplikací. První část bakalářské práce shrnuje aktuální informace o struktuře, funkci a evoluci halogenalkandehalogenas. Druhá část práce je pak věnována možnostem rozšíření dosavadních znalostí o této proteinové rodině za pomocí studie zaměřené na rekonstrukci sekvence předka. V práci jsou přiblíženy statistické přístupy a výpočetní programy používané pro předpověď sekvence předka in silico. Vybrané programy byly otestovány při předpovědi sekvence předka halogenalkandehalogenas DbeA a DbjA. V závěru jsou pak diskutovány odlišnosti mezi výsledky jednotlivých metod a problematika nejednoznačných předpovědí. Metodologie pro předpověď sekvence předka a informace o použitelnosti a limitacích jednotlivých nástrojů, kt  |% cze 
520 2 9 |a Haloalkane dehalogenases are enzymes that catalyze hydrolytic cleavage of the carbon-halogen bond in a wide range of halogenated compounds. These enzymes are often used as model systems to study principles of enzyme catalysis and also have a number of potential practical applications. The first part of the bachelor thesis summarizes current knowledge about structure, function and evolution of haloalkane dehalogenases. The second part is focused on the possibility to reconstruct ancestral sequences of selected haloalkane dehalogenases and thereby extend the knowledge about this protein family. Statistical approaches and programs for the in silico prediction of the ancestral sequences are described. Selected programs were used to predict the ancestral sequence of haloalkane dehalogenases DbeA and DbjA. Differences between results obtained from individual programs and prediction reliability are discussed. Described methodology and information about advantages and limitations of individual  |9 eng 
650 0 7 |a enzymy  |7 ph119969  |2 czenas 
650 0 7 |a halogenalkandehalogenasa  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a hydrogenázy  |7 ph311251  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulární biologie  |7 ph115344  |x metody  |2 czenas 
650 0 9 |a enzymes  |2 eczenas 
650 0 9 |a haloalkane dehalogenase  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a hydrogenases  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular biology  |x methods  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular biology  |2 eczenas 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Biologie  |b Molekulární biologie a genetika  |c PřF B-BI BIMG (BIMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Šebestová, Eva,  |d 1980-  |7 mub2013800408  |% UČO 40707  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/324015/prif_b/ 
CAT |c 20110624  |l MUB01  |h 0422 
CAT |a ANTLOVA  |b 02  |c 20110722  |l MUB01  |h 1005 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0149 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120412  |l MUB01  |h 0949 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20120824  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1247 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20140124  |l MUB01  |h 1100 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20140124  |l MUB01  |h 1116 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20140124  |l MUB01  |h 1117 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1146 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1447 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1408 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0201 
CAT |a JIRASKOVAX  |b 02  |c 20191025  |l MUB01  |h 2300 
CAT |c 20191220  |l MUB01  |h 1305 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0954 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1943 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1206 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11535  |5 3145352208  |8 20110722  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20110722  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11535  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD