Štúdium interakcií proteínov a telomerickej DNA
Konce lineárnych chromozómov, nazývané teloméry, sú chránené špecifickými proteinovými komplexami naviazanými na telomerickou úseky DNA. U človeka sa tento komplex šiestich proteinov označuje ako shelterin. Proteín TIN2 ma ústredne postavenie v shelterinovom komplexe, kde sa účastní na troch väzbách...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Slovenština |
| Vydáno: |
2008
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/184743/prif_m/ |
| Shrnutí: | Konce lineárnych chromozómov, nazývané teloméry, sú chránené špecifickými proteinovými komplexami naviazanými na telomerickou úseky DNA. U človeka sa tento komplex šiestich proteinov označuje ako shelterin. Proteín TIN2 ma ústredne postavenie v shelterinovom komplexe, kde sa účastní na troch väzbách, čo ho robí primárním cieľom pre podrobnejšie skúmanie k objasneniu stavby komplexu. V rámci tejto práce bola charakterizovaná interakcia proteínu TIN2 s proteínom TRF2. Po analýze väzby za použitia anisotropie fluorescencie, bola stanovená afinita väzby a určena disociačna konštanta. Výsledky tejto štúdie budú v budúcnosti využité pre porovnanie afinity TIN2 k ostatným proteínom shelterinového komplexu a prispejú takto k objasneniu spôsobu formovania shelterinového komplexu. Aj keď určenie stechiometrie proteínov TRF2 a TIN2 nebolo úspešné, táto práca môže poslúžiť pre ďalšie štúdie založené na retardačnej analýze TRF2 proteínu ako východzi štúdia pre zvýšenie gelovej mobility proteínu T The ends of linear chromosomes - telomeres are protected by specific protein complexes which bind telomeric ¬DNA. The human teleomere binding complex consisting of six proteins is called shelterin. Protein TIN2 has central position in shelterin complex. Protein TIN2 participates in three pivotal interactions within shelterin protein complex, which makes this protein primary target for detailed studies with the aim to clarify assembly and function of shelterin complex. In this diploma thesis, interactions of protein TIN2 with protein TRF2 were characterized. Measurements of fluorescence anisotropy were used for analysis of the binding affinity TIN2 and TRF2. The dissociation constant for the binding interaction was estiamted. The results of this study could be used for comparison of TIN2 binding affinity to other proteins of shelterin complex and could contribute to elucidate the mechanism of shelterin protein complex formation. Even though the estiamation of stochiometric ratio for i |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Ctirad Hofr Označení vytvoření práce je chybné, správně je: 2010, rok obhajoby 2011 |
| Fyzický popis: | 44 l. |