Epigenetic regulation of expression in plant transgenes
Tato práce byla zaměřena na studium epigenetických interakcí a epigenetické dědičnosti transgenních lokusů tabáku Nicotiana tobacum, které komunikují na úrovni posttranskripčního umlčení (angl. posttranscriptional gene silencing, PTGS). V experimentech byly použity dva transgenní lokusy. Lokus 1 je...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2008.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/11847/prif_d/ |
| Shrnutí: | Tato práce byla zaměřena na studium epigenetických interakcí a epigenetické dědičnosti transgenních lokusů tabáku Nicotiana tobacum, které komunikují na úrovni posttranskripčního umlčení (angl. posttranscriptional gene silencing, PTGS). V experimentech byly použity dva transgenní lokusy. Lokus 1 je uspořádán jako obrácená repetice a díky této struktuře je schopen produkovat poměrně silný RNA signál, který způsobuje metylaci DNA de novo jak ve své sekvenci, tak i v sekvenci jemu homologní a vede k umlčení genové exprese. Druhý lokus 2 má podobu jedné kopie transgenu a je k lokusu 1 homologní. Hybridní jedinec obsahující oba lokusy je v lokusu 1 silně metylován ve všech motivech a podél celé sekvence, zatímco lokus 2 má v kódující oblasti reporterového genu nptII (neomycinfosfotransferáza) převážně metylaci typu CG. Asymetrická metylace je omezena pouze na 3´UTR oblast. Tento hybridní stav vede ke kompletní represi genové exprese nptII genu a oba transgeny se jeví jako umlčené. Po odsegr. This work is focused on epigentic processes associated with posttranscriptional silencing of Nicotina tobacum transgenes and their trans-generation inheritance. In these experiments, two transgenic loci were used: locus 1 arranged as an inverted repeat transgene producing a strong RNA signal for de novo methylation and posttranscriptional gene silencing (PTGS) of a reporter gene encoding a bacterial neomycin phosphotransferase II (nptII). The second locus 2 is a naive single copy target locus with a 100% homology to locus 1. In a hybrid Lo1/Lo2 (combining both loci), the coding region of the target locus 2, a reporter nptII gene is methylated exclusively at CG dinucleotides, while non-CG methylation is located in the 3´untranslated region. Locus 1 is heavily methylated along the whole transcribed region and downstream sequence in both CG and non-CG motifs. Such hybrid plant is completely silenced with negligible expression activity. After segregating away the silencing locus 1 from hy. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Aleš Kovařík. |
| Fyzický popis: | 57 l., [34] s. : il. |