Molekulární typizace Staphylococcus aureus založená na detekci polymorfizmů u profágů
Cílem této práce bylo hodnocení metody profágové typizace provedené pomocí selektivní hybridizace se směsí fágových sond, ve smyslu její použitelnosti k typizaci blízce příbuzných kmenů S. aureus a její srovnání se stávajícími typizačními metodami. Nejdříve byla připravena směs profágově specifickýc...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2006.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/51804/prif_m/ |
| Shrnutí: | Cílem této práce bylo hodnocení metody profágové typizace provedené pomocí selektivní hybridizace se směsí fágových sond, ve smyslu její použitelnosti k typizaci blízce příbuzných kmenů S. aureus a její srovnání se stávajícími typizačními metodami. Nejdříve byla připravena směs profágově specifických hybridizačních sond značených digoxigeninem. Za tímto účelem byla identifikována a naklonována sekvence specifická pro fágovou seroskupinu Fb (fágový druh 77) a dvě univerzální fágové sekvence. Kromě nich byly k přípravě molekulárních sond použity také dříve naklonované sekvence specifické pro ostatní fágové seroskupiny (A, B, Fa a L) respektive druhy (3A, 11, 77 a 187). Směs fágově specifických sond byla hybridizována s HindIII a ClaI restrikčními spektry 18 příbuzných epidemických meticilin resistentních nemocničních kmenů S. aureus z několika nemocnic v Praze a Brně. Po zhodnocení výsledných DNA fingerprintů byla zjištěna 100% typovatelnost pro obě hybridizace a srovnatelné, poměrně vys. Molecular typing of Staphylococcus aureus based on the detection of polymorphisms in prophages. The aim of this work was to evaluate the potential of hybridization-based prophage typing as a method for typing of closely related strains of Staphylococcus aureus. The first part of the work included preparation of digoxigenin labeled, phage specific hybridization probes. For this purpose, serological group Fb (phage species 77) specific sequence and two universal phage sequences were identified and cloned. These were used for the preparation of molecular probes, together with the previously cloned phage sequences specific for other phage serological groups (A, B, Fa a L) and/or phage species (3A, 11, 77 and 187 respectively). The probes were mixed and hybridized with HindIII and ClaI restriction endonuclease patterns of 18 related epidemic methicillin-resistant hospital strains of S. aureus isolated in several hospitals in Brno and Praha. Resulting fingerprints were evaluated. Both hybr. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Roman Pantůček. |
| Fyzický popis: | 59 l. |